SULTAN

2025–2027

TB o No TB: Descifrando las Interacciones entre Microbioma y Hospedador Desde una Aproximación Multiómica y Basada en Aptámeros para Mejorar la Precisión Diagnóstica. Busca descubrir biomarcadores diagnósticos de tuberculosis (TB) derivados del microbioma y del hospedador en heces, mediante metodologías multiómicas y basadas en aptámeros, usando las cohortes STOOL4TB (Mozambique/Uganda; descubrimiento N=200, validación interna N=100) y NAAT-TB (España; validación externa N=60).

MIMIC

2026–2028

Microbiome-Based Interventions in Inflammaging: Discovery and Preclinical Testing of Antiinflammatory Agents. Estudio multicéntrico CIBER que caracteriza las interacciones huésped-microbioma en la inflamación asociada a la edad (inflammaging) en tres grupos de edad (niños, mediana edad, mayores de 80) y varias condiciones (artritis, VIH, obesidad), con el objetivo de descubrir compuestos moduladores del microbioma con potencial antiinflamatorio.

TURBO

Estudio de metaproteómica fecal en controladores de élite del VIH (personas que controlan la infección de forma espontánea, sin tratamiento) para identificar proteínas microbianas asociadas al control inmunológico, con vistas a su validación dirigida por espectrometría de masas.

MEDAL KIT

2026–2028

Kit diagnóstico in vitro (IVD) que mide dos metabolitos derivados del microbioma (succinil-CoA y cobalamina), sobreexpresados por bacterias asociadas a HSIL, en hisopos anales recogidos durante la citología estándar (plataforma ELONA, ensayo colorimétrico basado en aptámeros).

RUMBA-CM

2026–2028

Reprogramming The Tumor Microenvironment Through Microbiome-Derived Immunomodulatory Molecules. RUMBA investiga cómo el microbioma intestinal de pacientes con respuestas excepcionales a la inmunoterapia puede ser fuente de moléculas inmunomoduladoras (MIMOs) que reviertan el agotamiento de linfocitos T en el microambiente tumoral, combinando cribado por aptámeros, organoides derivados de paciente, organ-on-chip y validación preclínica en ratón.

MORELIA

Ensayo clínico de trasplante de microbiota fecal (FMT) combinado con inmunoterapia en cáncer de pulmón no microcítico (CPNM).

SPHYNX

2027–2028

Uncovering Altered Syphilis Immune Responses and Next-Generation Diagnostics for People Living with HIV through Host-Pathogen Interaction Exploration (título oficial de la propuesta: SPHINX). Desarrollo y validación de un diagnóstico basado en la respuesta del huésped (tipo IGRA) que mide perfiles de liberación de citoquinas específicas de antígeno para distinguir infección activa por Treponema pallidum de exposición pasada, optimizado para personas con VIH.

INSTINCT

2019–2023

Ensayo clínico aleatorizado, multicéntrico y abierto sobre el impacto de cambiar de terapia antirretroviral dual a triple en los marcadores de inflamación en personas con VIH.

PRETTY

2023–2024

Valor predictivo de los perfiles inflamatorios medidos tras dos años de tratamiento antirretroviral eficaz sobre la aparición de eventos clínicos no asociados al sida, con proteómica dirigida sobre las cohortes CoRIS y CNICS.

AIR

2018–2019

Efecto de la simplificación del tratamiento antirretroviral sobre los marcadores inflamatorios, analizado en la cohorte española CoRIS.

Inmunogenicidad de la vacuna VPH-9

2017–2022

Predictores de inmunogenicidad de la vacuna nonavalente frente al virus del papiloma humano en hombres con VIH que tienen sexo con hombres.

PROTECTIVE

2020–2022

Estudio de cohorte prospectivo multicéntrico que explota las respuestas inmunitarias protectoras frente a la COVID-19 para identificar los mecanismos asociados a una evolución clínica favorable.

SCRAtCH

2018–2022

Cribado del cáncer anal basado en el microbioma en personas con VIH. Consorcio de seis centros (España, Italia, Alemania) que reclutó más de 1.000 adultos con VIH e integró secuenciación metagenómica shotgun con modelos de aprendizaje automático, generando el primer biomarcador de microbiota en heces capaz de estratificar el riesgo de cáncer anal, y armonizando los protocolos de cribado entre hospitales.

METEOR

2023–2025

Caracterización experimental y explotación clínica de potenciadores de la respuesta inmunitaria asociados al microbioma. Combinó aproximaciones multiómicas para cartografiar las rutas que amplifican las respuestas IFN-γ y T folicular helper con ensayos de inmunoestimulación para cribar y priorizar más de 200 aislados bacterianos, con el objetivo de convertirlos en adyuvantes probióticos de nueva generación.

REFRESH

2017–2022

Ensayo clínico fase I/II aleatorizado, doble ciego y controlado con placebo de trasplante de microbiota fecal a dosis bajas y repetidas en personas con VIH.

ARTIBIOME

2020–2022

Efecto del tratamiento antirretroviral triple basado en inhibidores de la integrasa sobre el microbioma intestinal, estudiado en hombres que tienen sexo con hombres sin VIH que reciben profilaxis post-exposición — un diseño que permite aislar el efecto del fármaco del efecto de la propia infección.

Microbiota y precáncer anal

2016–2018

Influencia de la microbiota intestinal en el desarrollo de lesiones precancerosas anales en personas con VIH. Primer proyecto del grupo en esta línea, del que derivan SCRAtCH, BIOSCAN y MEDAL.

BIOSCAN

2024–2025

Desarrollo de un biosensor para la identificación de lesiones precancerosas anales, como vía de traslación de los biomarcadores de microbioma identificados por el grupo hacia un dispositivo de uso clínico.